A Vagrant Queen segue Elida da rainha da criança para a marginalizada órfã, enquanto ela vasculha os cantos traiçoeiros da galáxia, sempre um passo à frente do governo da república para extinguir sua linhagem. Quando seu velho amigo Isaac aparece afirmando que sua mãe Xevelyn ainda está viva, eles partem com sua nova aliada Amae para realizar um resgate que a levará de volta ao coração perigoso de seu antigo reino e contra um inimigo mortal de sua infância, Comandante Lazaro.